История работы ветеринарной лаборатории уходит корнями в далекое прошлое. Впервые Томская губернская ветлаборатория была открыта в 1899 году. Тогда она исполняла роль диагностического кабинета и размещалась в помещении ветеринарно-фельдшерской школы вместе с ветлечебницей. В 1904 году Томское губернское управление постановило приобрести дом для размещения ветеринарно–бактериологической лаборатории.
1 июля 1922 года этот день считается днем рождения Томской губернской, а затем и областной ветеринарной лаборатории. В 1926 году лаборатории было отведено здание по адресу улица Розы Люксембург, дом № 29, где и по сей день находится лаборатория.
В 1947 году в лаборатории уже существовали такие отделы как бактериологический, терапевтический, хирургический, гинекологический и эпизоотический. В 1962 году организуется радиологический отдел, в 1983 году дополнительно организованно 4 отдела: биохимический, диагностический, отдел по болезням птиц и ветеринарно-санитарной экспертизы (ВСЭ).
В настоящее время в ОГБУ «Томская областная ветеринарная лаборатория» (ОГБУ ТОВЛ) функционируют: бактериологический, серологический, вирусологический, радиологический отделы, отдел ВСЭ и химико-токсикологический отдел.